Евгения Григорьевна ежегодно выступала с сольными концертами. В историю российского музыкального искусства ХХ века она вошла как третий человек, сыгравший все клавирные произведения И.С. Баха. Пианистка в течение нескольких десятилетий пропагандировала в России музыку классиков и творчество современных композиторов-авангардистов. Последний концерт пианистки состоялся в Концертном зале Уфимского училища искусств 16 июня 2021 года.
Министерство культуры Республики Башкортостан выражает глубокие соболезнования родным и близким Евгении Григорьевны Пупковой.